Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms