Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC7AQ5VTJ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHDC7AQ5VTJ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms