Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms