Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC122Q5T0U0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC122Q5T0U0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms