Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HP1BP3Q5SSJ5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms