Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCID2Q5JVF3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms