Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AKAP4Q5JQC9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AKAP4Q5JQC9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms