Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODF2Q5BJF6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms