Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CERKLQ49MI3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CERKLQ49MI3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms