Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NBPF1Q3BBV0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NBPF1Q3BBV0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms