Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC27Q2M243 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC27Q2M243 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms