Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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