Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 449.3 ms