Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCBQ16585 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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