Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACKR1Q16570 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACKR1Q16570 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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