Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GABRA6Q16445 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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