Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD5Q16401 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD5Q16401 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms