Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SSX2Q16385 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SSX2Q16385 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SSX2Q16385 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX2Q16385 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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