Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF56Q15929 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF56Q15929 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms