Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1EQ15878 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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