Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN9AQ15858 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN9AQ15858 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN9AQ15858 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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