Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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VAMP3Q15836 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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VAMP3Q15836 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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VAMP3Q15836 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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VAMP3Q15836 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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VAMP3Q15836 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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VAMP3Q15836 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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VAMP3Q15836 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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VAMP3Q15836 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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VAMP3Q15836 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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