Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85BQ15834 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85BQ15834 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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