Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITSN1Q15811 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ITSN1Q15811 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ITSN1Q15811 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
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