Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIP11Q15643 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP11Q15643 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
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