Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPAQ15257 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPAQ15257 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms