Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX17Q15036 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX17Q15036 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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