Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CHD4Q14839 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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CHD4Q14839 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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CHD4Q14839 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHD4Q14839 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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CHD4Q14839 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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CHD4Q14839 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
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CHD4Q14839 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
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CHD4Q14839 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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CHD4Q14839 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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CHD4Q14839 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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CHD4Q14839 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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