Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF235Q14590 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF235Q14590 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms