Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN5AQ14524 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN5AQ14524 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN5AQ14524 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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