Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSHL1Q14406 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSHL1Q14406 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CSHL1Q14406 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSHL1Q14406 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSHL1Q14406 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSHL1Q14406 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSHL1Q14406 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSHL1Q14406 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSHL1Q14406 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSHL1Q14406 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSHL1Q14406 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSHL1Q14406 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSHL1Q14406 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSHL1Q14406 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSHL1Q14406 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CSHL1Q14406 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSHL1Q14406 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSHL1Q14406 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSHL1Q14406 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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