Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A2Q14055 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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