Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIRBPQ14011 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CIRBPQ14011 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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