Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP5Q14008 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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