Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LAMB3Q13751 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMB3Q13751 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms