Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FHL3Q13643 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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