Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTCH1Q13635 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
PTCH1Q13635 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
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