Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SF3B2Q13435 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
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