Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRDNQ13061 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
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