Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TROQ12816 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TROQ12816 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TROQ12816 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TROQ12816 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TROQ12816 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TROQ12816 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TROQ12816 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TROQ12816 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TROQ12816 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TROQ12816 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TROQ12816 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TROQ12816 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TROQ12816 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TROQ12816 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TROQ12816 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TROQ12816 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TROQ12816 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TROQ12816 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TROQ12816 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TROQ12816 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TROQ12816 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TROQ12816 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TROQ12816 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TROQ12816 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TROQ12816 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TROQ12816 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TROQ12816 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TROQ12816 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TROQ12816 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TROQ12816 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TROQ12816 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TROQ12816 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TROQ12816 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TROQ12816 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TROQ12816 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TROQ12816 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TROQ12816 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TROQ12816 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TROQ12816 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TROQ12816 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TROQ12816 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TROQ12816 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TROQ12816 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TROQ12816 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TROQ12816 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TROQ12816 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TROQ12816 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TROQ12816 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TROQ12816 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TROQ12816 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TROQ12816 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TROQ12816 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TROQ12816 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TROQ12816 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TROQ12816 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TROQ12816 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TROQ12816 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TROQ12816 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TROQ12816 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TROQ12816 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TROQ12816 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TROQ12816 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TROQ12816 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TROQ12816 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TROQ12816 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TROQ12816 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TROQ12816 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TROQ12816 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TROQ12816 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TROQ12816 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TROQ12816 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TROQ12816 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
TROQ12816 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TROQ12816 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TROQ12816 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TROQ12816 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TROQ12816 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TROQ12816 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TROQ12816 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TROQ12816 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TROQ12816 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TROQ12816 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TROQ12816 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TROQ12816 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TROQ12816 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TROQ12816 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms