Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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