Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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