Protein–RNA interactions for Protein: Q12141

TY1B-GR1, Transposon Ty1-GR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR1Q12141 CLN3YAL040C 1743 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 CDC9YDL164C 2268 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 DOM34YNL001W 1161 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 TDA9YML081W 3756 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 SPB1YCL054W 2526 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 LSM8YJR022W 330 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 ERV1YGR029W 570 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 COG3YER157W 2406 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 RDH54YBR073W 2877 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 SLM5YCR024C 1479 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 MOB2YFL034C-B 864 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 CDC20YGL116W 1833 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 SRB5YGR104C 924 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 YLL037WYLL037W 381 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 EMG1YLR186W 759 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 GLO1YML004C 981 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 SDC25YLL016W 3147 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 YMR018WYMR018W 1545 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 SPT16YGL207W 3108 nt3.46□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 PDR11YIL013C 4236 nt3.46□□□□□ -1.85
TY1B-GR1Q12141 INO2YDR123C 915 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 BRP1YGL007W 378 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 PRM7YDL039C 2097 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 VIP1YLR410W 3441 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 RPN1YHR027C 2982 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 AIM32YML050W 936 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 MAK11YKL021C 1407 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 TCD1YHR003C 1290 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 HSC82YMR186W 2118 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 NUP170YBL079W 4509 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 YFL015CYFL015C 495 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 EMP24YGL200C 612 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 ROT1YMR200W 771 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 BYE1YKL005C 1785 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 ACT1YFL039C 1128 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 SIC1YLR079W 855 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 GCN1YGL195W 8019 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 ALK2YBL009W 2031 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 BCK2YER167W 2556 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 SSE1YPL106C 2082 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 TAO3YIL129C 7131 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 RFT1YBL020W 1725 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 TTI2YJR136C 1266 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 PNO1YOR145C 825 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 SIN3YOL004W 4611 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 YNL013CYNL013C 378 nt3.4□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 STB2YMR053C 2553 nt3.4□□□□□ -1.86
TY1B-GR1Q12141 NSP1YJL041W 2472 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 GYP5YPL249C 2685 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 GIS4YML006C 2325 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 KSP1YHR082C 3090 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 MYO3YKL129C 3819 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 QRI7YDL104C 1224 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 PEX4YGR133W 552 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 COX2Q0250 756 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 YIL025CYIL025C 375 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 SRL3YKR091W 741 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 ERV41YML067C 1059 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 SEC66YBR171W 621 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 YBR226CYBR226C 411 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 MRPS9YBR146W 837 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 RTS1YOR014W 2274 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 POL12YBL035C 2118 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 GCN4YEL009C 846 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 IKS1YJL057C 2004 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 SPT2YER161C 1002 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 YBR209WYBR209W 318 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 SMC2YFR031C 3513 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 GAL80YML051W 1308 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 AIM22YJL046W 1230 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 DLS1YJL065C 504 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 ECI1YLR284C 843 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 BAR1YIL015W 1764 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 GIP4YAL031C 2283 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 YGL024WYGL024W 336 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 SIP18YMR175W 240 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 REX4YOL080C 870 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 GCV2YMR189W 3105 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 MGM1YOR211C 2646 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 USE1YGL098W 738 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 INO4YOL108C 456 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 SRB8YCR081W 4284 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-GR1Q12141 RRP12YPL012W 3687 nt3.34□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 TEL1YBL088C 8364 nt3.34□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 RAD7YJR052W 1698 nt3.34□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 BCH2YKR027W 2298 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 YCR064CYCR064C 411 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 PRP11YDL043C 801 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 RPS16BYDL083C 432 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 YPT53YNL093W 663 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 TAF3YPL011C 1062 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 APP1YNL094W 1764 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 FRE4YNR060W 2160 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 MSA1YOR066W 1890 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 RPC34YNR003C 954 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 PEX6YNL329C 3093 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 SIN4YNL236W 2925 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 YGL188CYGL188C 174 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 PDC2YDR081C 2778 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-GR1Q12141 MCD4YKL165C 2760 nt3.31□□□□□ -1.88
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