Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ABCC8Q09428 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ABCC8Q09428 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC8Q09428 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC8Q09428 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC8Q09428 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC8Q09428 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC8Q09428 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC8Q09428 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC8Q09428 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC8Q09428 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC8Q09428 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC8Q09428 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms