Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP4Q09028 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms