Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF543Q08ER8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms