Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDR1Q08345 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms