Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLEQ07864 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLEQ07864 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLEQ07864 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLEQ07864 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLEQ07864 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLEQ07864 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLEQ07864 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLEQ07864 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLEQ07864 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLEQ07864 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLEQ07864 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLEQ07864 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLEQ07864 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLEQ07864 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLEQ07864 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLEQ07864 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLEQ07864 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLEQ07864 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLEQ07864 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLEQ07864 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLEQ07864 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLEQ07864 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLEQ07864 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLEQ07864 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLEQ07864 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLEQ07864 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLEQ07864 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLEQ07864 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLEQ07864 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms