Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms