Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTK2Q05397 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTK2Q05397 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms